Gittikçe derinleşen bir film senaryosuna dönüşen X-Men çizgi romanının son filmi The Wolverine, isminden de anlaşılacağı üzere Logan yani en özel yeteneklere sahip mutant olan Wolverine üzerine çekilmiş bir film. Logan (Hugh Jackman)’ın geçmişine giden filmde, eskiden esir olarak alındığı Japonya’nın Nagazaki bölgesine atom bombası atılınca, Logan ölümsüzlük özellikleri sayesinde kurtulur. Buradan başlayan hikayede, bölgedeki Yashida adında bir Japon askerini kurtaran Wolverine, bu sayede adamın sadakatini kazanmış olur. Bu olayların üzerinden geçen yıllarda Yashida, oldukça zengin biri olur. Yıllar önce kendisini ölümden kurtaran Logan’ı unutmaz ve yanına Japonya‘ya davet eder. Bu sırada Logan sahip olduğu ölümsüzlük özelliğinin insanlara zarar verdiğini düşünmektedir ve kendini insanlardan soyutlayarak ormanlık bir alanda tek başına yaşamaktadır. Daveti kabul ederek Japonya‘ya giden Logan, beklediği manzara ile karşılaşmayacaktır…